ヘドウィグ ロビンソン (ジョン キャメロン ミッチェル) は、ヘドウィグ アンド ザ アングリー インチと呼ばれるロック バンドのリード シンガーです。 ヘドウィグは、かつての恋人であるトミー・グノーシス (マイケル・ピット) が彼女の曲を盗み、大スターになったことに激怒している。 彼女は著作権訴訟とトミー自身の両方を追求している。たまたま、アングリーインチの小規模な会場が、トミーが売り切れのコンサートを行っているのと同じ都市にある.
曲の合間に、ヘドウィグは彼女の人生の物語を彼女の貧弱な聴衆に向けて大げさに言います。 彼女のナレーションとフラッシュバックを通じて、彼女が東ベルリンのヘンゼルという名前の「女の子のような少年」として成長し、横暴な母親と一緒に小さなアパートに住んでいたことがわかります。 壁の向こう側で本当の愛を見つけることができなかったヘンゼルは、残りの半分を見つけることを期待して西に逃げることを夢見ていました. アメリカの軍人であるルーサー (モーリス・ディーン・ウィント) は、結婚してアメリカに移住できるように性別適合手術を受けるよう説得します。
ヘンゼルの母親は怪しげな医者に手術を手配するが、手術はうまくいかない。 ヘンゼルは、肉の山である名高い怒りのインチで傷ついたままになっています」 [his] 陰茎はどこにあった [his] ヘンゼルは母親の名前を採用し、ヘドウィグになり、ルーサーと一緒にカンザス州ジャンクションシティに引っ越しますが、結婚生活の至福は短命です。家からマイル。
一人で落ち込んでいるヘドウィグは、金髪のかつらに力を見出し、韓国軍の妻数人とバンドを始め、まだ彼女の残りの半分を見つけることを夢見ています。 その時、彼女はベビーシッターのギグを取得し、素朴なクリスチャンの子供であるトミーと出会い、2人はすぐにつながりを築きます。