2022年11月、 スイスの科学者たちは、エチオピアの田舎から待望のパッケージを開封しました。 たわごとでいっぱいでした。
公衆衛生研究者の Abdifatah Muhummed は、人間の腸内細菌の多様性を目録化して保存するための世界的な取り組みの一環として、エチオピアのソマリ州の人里離れた牧畜民コミュニティの子供たちから 2 か月間、便のサンプルを収集していました。 彼は各サンプルを 4 つのチューブに分割し、摂氏 -80 度で凍結させ、そのうちの 2 つをヨーロッパに発送しました。
何兆もの細菌、真菌、およびその他の微生物が消化管に住んでいます。 それらの多くは人間の健康に有益であり、例えば代謝や免疫システムに影響を与えます。 しかし、その多様性は、工業化、都市化、環境変化の脅威にさらされています。
ムハンマドが収集したサンプルのいくつかを分析したとき、それらをペトリ皿で培養し、染料を加えて顕微鏡で見えるようにしました。彼は、暴露されたことのない子供から採取されたサンプルでさえ、抗生物質耐性の兆候を見つけたことに驚いていました現代の抗生物質に。
これが、科学者がグローバル バイオバンク (いわば微生物のノアの箱舟) を作成し、手遅れになる前に世界中のサンプルを永久に保管したいと考えている理由の 1 つです。 「もちろん、私たちが何を失っているかを具体的に言うのは難しいです」と、チューリッヒに拠点を置く微生物学者のエイドリアン・エグリは言います。 Microbiota Vault プロジェクト.
食事は人間のマイクロバイオームに影響を与えるため、牧畜民の糞便サンプルは科学者にとって特に興味深いものです。 「彼らのライフスタイルは、都市部や都市部に住む人々とはまったく異なります」と、ジグジガ大学、スイス熱帯公衆衛生研究所、スイス大学の共同研究の一環として 350 以上のサンプルを収集した博士候補のムハンマドは言います。バーゼル。
牧畜民は牛乳を主食とするため、食事には脂肪酸が豊富に含まれています。 しかし、牧畜民は生まれつき遊牧民であり、ヒツジ、ヤギ、ラクダの群れを、東アフリカで何年にもわたる干ばつの後に残された数少ない放牧地の間で移動させるため、これまで健康研究で調査されることはめったにありませんでした。 彼らは医療へのアクセスがほとんどありません。
より多くの人々が都市に移動するにつれて、彼らは新しい食習慣を取り入れ、異なる環境にさらされます. ムハンマド氏によると、エチオピアの牧畜民も米やパスタなどの食料品を購入し始めているという。 これにより、マイクロバイオームの組成が変化し、腸内に生息する特殊なバクテリアが絶滅する可能性があります.
Microbiota Vault では、さまざまな種類の細菌が完全に失われないように、世界中の健康な人々から採取された何万もの便サンプルがいつの日か恒久的に保存される可能性があります。 それらは、病気を治療するために復活させ、培養することさえできます 遠い未来に.
すでにあります 数十のスツールバンク そして、研究者たちがヒトマイクロバイオームを配列決定するための数多くの継続的な努力を行っており、その全員がバックアップとしてサンプルを保管庫に保管したいと考えているかもしれません。 ノアの箱舟のように、寄稿研究者はサンプルを 2 つの標本に分けます。1 つは保管庫用、もう 1 つはローカルに保管するためです (サプライヤーはすべてのサンプルの所有権を保持します)。 「ギブアンドテイクであり、双方にとってウィンウィンです。 私たちはインフラストラクチャを提供しますが、ある時点でシーケンス データにアクセスすることもできます」と Egli 氏は言います。 一方、Microbiota Vault プロジェクト チームは、国際的な研究を促進するために、標準化された形式でシーケンス データを文書化して公開することを目指しています。
実際の保管庫 (現在はチューリッヒ大学のエグリの研究室にある冷凍庫) がどこに建設されるかはまだ未定です。 スバールバル世界種子貯蔵庫 ノルウェーで、または座って アルプスの軍事バンカーを改造; スイスの政治的安定性、優れたインフラストラクチャ、およびジュネーブの世界保健機関などの国際機関とのつながりにより、スイスは適切な候補となっています。 100 万ドルの資金は、2024 年までのプロジェクトのパイロット段階をカバーします。
彼らのビジョンを実現するために、エグリと彼の同僚はまず、どの冷凍技術と保存剤が細菌を長期的に生き続けるのに最適かをテストする必要があります. 彼らは、サンプルの最初のバッチが解凍され、2 年後に再び配列決定されたときに、これを発見するでしょう。 「そうすれば、どの方法が微生物の多様性を維持するのに最も適しているかがわかります」と彼は言います。
この記事はもともと、WIRED UK マガジンの 2023 年 1 月/2 月号に掲載されたものです。