現在、新しいパラダイムを採用している企業もあります。すべてを測定し、後で質問するというものです。 このモットーは、ハーバードと MIT のブロード研究所の研究室を動かしています。研究者たちは、細胞の内部構造に関する情報の宝庫を生成する方法を開発しました。 セル ペインティングとして知られるこの方法は、いくつかの製薬会社の科学者に感銘を与えました。製薬会社はコンソーシアムを立ち上げてリソースをプールし、このアプローチを使用して大量のデータ セットを作成し、11 月に公開を開始しました。 の JUMP–セルペインティングコンソーシアムと呼ばれているように、研究者が有望な化合物を特定し、分子が動物や人でテストされる前に、それらが何をするのか、どのような種類の副作用があるのか をよりよく理解するのに役立つことで、データベースが創薬を加速することを期待しています.
Cell Painting は、核やミトコンドリアなどの細胞の主要な構成要素を照らすために、最大 6 つの蛍光色素を使用します。 顕微鏡がさまざまな汚れの画像をスナップし、ソフトウェアがサイズ、形状、強度、テクスチャなどの形態学的特徴を測定して、サンプルの画像ベースのプロファイルを作成します。 この方法を開発し、ブロード研究所の研究室をシャンタヌ・シンと共同で率いる計算生物学者のアン・カーペンターは、「これは、管理できる最も簡単なイメージング アッセイです」と述べています。 「私たちの使命は、絶対的に安くて簡単な染料を選ぶことでした。」
使いやすさだけでなく、Cell Painting の威力は、1 つの実験から得られる膨大な量のデータにあります。 新しくリリースされたデータベースには、140,000 を超える摂動 (薬物治療または遺伝子の活性を上下させるその他の変更) に応答する細胞の画像が含まれています。 このデータセットを使用して、カーペンターと彼女の同僚の何人かは、急速に成長している筋肉癌に関与する重要な遺伝子によって影響を受けるのと同じ構造に影響を与えると思われる多数の化合物を発見しました. ブロードの研究者は、何百ものサンプルを複数回のウェットラボ実験にかけるのではなく、遺伝子の名前をデータベースに入力することで、数年前に薬物リストを作成しました。
ペンシルバニア大学の生物学者で、この特定の筋肉がんを研究している TS Karin Eisinger は、次のように述べています。 彼女のチームはカーペンターズと協力して、湿式実験室試験で化合物を検証しました。2 人の科学者は、最も有望な候補をさらに開発する会社を立ち上げています。 カーペンターが顧問を務めるソルトレイクシティの会社、リカージョン・ファーマシューティカルズは、細胞ペインティングのバージョンを使用して特定された薬剤候補をテストするための 5 つの臨床試験をすでに開始しています。
公開を締めくくるにあたり、コンソーシアムのメンバーは、ワシントン DC に本拠を置く健康環境科学研究所と協力して、Cell Painting の結果を他のデータと組み合わせて医薬品や農薬の毒性を予測できるかどうかを確認する準備を進めています。 .
エスター・ランドハウス は、サンフランシスコのベイエリアを拠点とする科学と健康のジャーナリストです。