歴史的に、シェルタ洞窟は米国東部で最も多様な洞窟システムの1つでした。 ニーミラーや他の科学者がやってくるずっと前から、カブトムシ、サンショウウオ、エビ、ザリガニ、その他の動物は暗闇の中で暮らしていました。 多くの場合、盲目で色素沈着がないため、多くの洞窟に生息する種は、代謝が遅いため、表面に生息する親戚よりも長生きします。これは、地下生活への一般的な進化的適応です。 たとえば、アメリカザリガニ、多くの不幸な星 ルイジアナザリガニの煮物、彼らが故郷と呼ぶ沼地や溝で最大5年間生きることができます。 シェルタの南洞窟ザリガニ、 O. australis、 22歳まで生きる、そしてシェルタ洞窟のクレイフィッシュも同様の寿命を持っていると考えられています。
灰色のコウモリのコロニーもシェルタ洞窟を彼らの家にしました。 手のひらに収まるほど小さいこれらの愛らしい毛皮のような「コウモリ」は、洞窟全体にグアノを堆積させました。これは、シェルタ洞窟のクレイフィッシュを含む他の多くの洞窟の生き物にとって貴重な食料源です。 何世紀にもわたって、コウモリ、ザリガニ、その他のシェルタ洞窟の動物のバランスの取れた生態系は、邪魔されずに続けられました。
その後、起業家のヘンリー・M・フラーがやって来ました。 シェルタ洞窟自然保護区を管理しているスコット・ショーによれば、1888年にフラーは洞窟を購入し、娘にちなんで名付けました。 1年後、フラーは木製のダンスフロアを建設し、街で最初の電灯を洞窟に設置して、人気のある娯楽目的地を作りました。 雨水が地下湖を膨らませたとき、フラーは訪問者のために木製のボートツアーさえ運営しました。 洞窟に「世界の8番目の不思議」というニックネームを付けて、フラーは走りました 広告 それは、「地球上または地球下のこの最大の光景と比較して、旧世界のすべての発見は取るに足らないものに見えます」と自慢していました。 「ええ、それは大きな出来事でした」とショーは言います—しかしそれは続くことを意図されていませんでした。
1896年以降、シェルタは何度か手を変え、禁酒法の期間中はスピークイージーにさえなったと伝えられています。 1967年、洞窟を研究して保護する組織であるNational Speleological Society(NSS)は、その独特の生態系を保護するために洞窟を購入しました。