あなたの胃腸管で何が起こっているのですか？ さて、私たちは一般的な考えを持っていますが、そこに住む腸と微生物が多種多様な健康問題において重要な役割を果たしているという証拠が増えています。 ペルセポネはバイオテクノロジーのスタートアップです それ—1500万ドルと 多く of poop —人間の微生物叢のライブラリを構築し、消化を容易にすることから深刻な病気と戦うことまですべてを行うことができる有用な生命体の最良のリストを集めています。
迅速な遺伝子配列決定のようなかつては排他的で高価なツールの民主化は、新世代のバイオテクノロジー企業と治療アプローチを育ててきました。 この場合、すべての人の微生物叢（私たちの体の内外に生息し、相互利益のためにさまざまなタスクを実行する多くの場合ユニークな微生物のセット）がどのように異なり、それらの違いが私たちの健康に何を意味するかを詳しく調べています。
共同創設者のステファニー・カラーは、ジェノマティカでの遺伝子研究のバックグラウンドから来ました。そこでは、通常は石油から供給される化学物質を、バクテリアを発酵によって改変することによって生産することに取り組んでいました。
「5年間の遺伝子工学が必要でしたが、うまくいきました。バクテリアを操作する方法の青写真を作成することができました」と彼女は言いました。 「現在、同じツールを使用して同様のことを行っています。 しかし、以前は1つの微生物をマッピングしていましたが、現在は複数の微生物を使用して、腸内バイオーム全体の正確なマップを作成しています。」
この分野には基本的な理解が不足していると彼女は説明した。 それが多くのプロセスに関与しているという証拠にもかかわらず、微生物叢が病気の進行にどのように影響するか、治療の有効性、免疫系の発達、さらにはアレルギーのようなものなどの質問に答えるには歴史的に不十分なデータがありました。 その理由の一部は、十分な生の研究資料を収集することが難しいことです。
ペルセポネのオールインワン「うんちキット」。
同社は、健康でさまざまな状態に苦しんでいる多数の人々からの糞便サンプルの骨の折れる収集を通じて、大規模なデータセットで機械学習モデルをトレーニングしました。
「うんちのサンプルを与えるのは簡単ではありません—汚名があります」とカラーは説明しました。 「それで、私たちはそれを簡単に行う方法に焦点を合わせました。 YCombinatorを通じて得た初期資金 [one of our favorites in 2018] 大量の患者データを取得するために、そのインフラストラクチャを開発する準備をしてください。」
サンプル内の微生物が分離され、配列が決定され、カタログ化された後、そのデータは、血液検査、行動、投薬など、他の多くの健康記録と組み合わされました。 機械学習は、この種のノイズの多いデータセットを効率的に分類する方法であり、調査する価値のあるパターンと、Cullerが微生物の中で「スーパーヒーロー」と呼んだものの両方を特定しました。
たとえば、特定の菌株または機能的なタイプの細菌は、結腸直腸癌の診断に先立つ数年で腸内で死滅する可能性があります。 なんで？ 誰も知りませんが、あなたは知りません 持ってる 命を救うためのそのような初期のマーカーを知ること。 そして、その存在を回復できるとしたらどうでしょうか？ それは非常によくポジティブな治療または予防効果をもたらす可能性があります。
「あなたと私は同じ細菌の異なる菌株を持っているかもしれませんが、あなたが望む優れた機能のコンセンサスセットがあります」とCullerは言いました。 「しかし、病気の研究では、それらは完全に欠落しているか、他の恐ろしい菌株を持っている可能性があります。」
画像クレジット： Persephone Biome
「私たちが年をとると、食事が変わり、病気になり、抗生物質を服用します…そして微生物叢が消え始めます」と彼女は続けました。 「私たちはすべての適切な微生物を切り上げようとしています。1つのサイズですべてに適合し、データに基づいてトレーニングされ、すべての人が必要とする生物のコンセンサスセットです。プロバイオティクスの新しいカテゴリである1つのスーパーピルです。」
それよりも少し複雑ですが、Cullerは詳しく説明しました。 年齢層や条件が異なれば、ニーズも異なる可能性がありますが、スーパーヒーローセットはおそらく誰にとっても役立つ（そして確かに有害ではない）でしょう。
あなたはこれらがすでにそこにあるプロバイオティクスの錠剤や飲み物とどのように違うのか疑問に思うかもしれません。 まあ、それらは一部の人には役立つかもしれませんが、真実はそれらが実際には私たちの地元の微小動物相ではないということです。
「私たちが市場に出しているものの多くは、100年以上前に発見されたレガシー株であり、それらの多くはミルクベースの製品からのものです。これらは腸内細菌叢の実際のメンバーではありません。 150の製品を分析したところ、健康な微生物叢と重複する菌株は29株しかありませんでした」とCuller氏は述べています。 （そしてスーパーヒーローはいません。）
それを彼らが特定した何千もの候補者と比較してください。それらはすべて人々から直接供給されており、最近ではそれで、とりわけ現代の食生活を反映しています。 1世紀前に誰かがミルクで見つけた生き物の代わりに、実際の人間から最高の品種を手に入れることができます。
ペルセポネには大きく分けて2つの方法があり、どちらも来年中に実現することを望んでいます。 2つのうち簡単なのはプロバイオティクスサプリメントです。これは、FDAによって「一般的に安全と認められている」とテストされ、発見されるだけで済みます。 これは、一般的な健康上の利点が示唆されているが、何かを治すような治療上の主張がなされていない他のサプリメントと同じ指定です。
これらのサプリメントは、帝王切開、抗生物質、処方などの理由で不完全な腸内微生物叢を持って生まれる乳児が増えているため、最初は小児用に使用されます。 それらは有益ですが、腸に悪影響を及ぼしているように見えます。おそらく、とりわけアレルギーの大幅な増加に寄与している可能性があります。 常温保存食品の液体プロバイオティクス添加物は、新しい親のベビーバッグへの標準的な添加物である可能性があります。
ペルセポネの従業員は会社の研究室で働いています。
乳児の腸バイオームのさらなるテストが必要であり、ペルセポネは乳児の健康に関する大規模な新しいパートナーシップと、これをすぐにダイヤルするのに役立つ新しい全国的な研究を発表する予定です。 幸いなことに、「赤ちゃんのうんちの収集はとても簡単です」とカラーは言いました。 どちらかといえば、親のサンプルが多すぎます。
同社は、過敏性腸症候群、炎症、およびこれらの微生物が影響を与える可能性のあるその他の問題の緩和などの特定のアプリケーションを調査しながら、時間の経過とともに高齢者や成人にスケールアップします。
ペルセポネが並行して追求している別の方法は、微生物を癌治療に治療的に適用し、免疫療法薬の効果を高めることができると理論づけられています。 これは、臨床試験を通じてより深刻なFDAの承認を必要とするタイプのものです。
「来年半にはクリニックに行きたいと思っています。 肺がんについては、2024年には間違いなく参加する予定です」と、ジョンソン・エンド・ジョンソンとのコラボレーションの一環として、カラー氏は述べています。 「腫瘍学を超えて、私たちは脳腸軸に非常に興味があります。 これらのスーパーバグ [i.e. the superhero microbes, not viruses] どんな病気にとっても重要です。」
また、新しい合成バイオテクノロジーに関するGinkgo Bioworksとの新しいコラボレーション、および癌の検出と治療のためのバイオマーカーを探す腸免疫軸の大規模な研究であるARGONAUTもあります。 会社のプレートにはたくさんあるので、Persephoneを利用した研究がある程度の頻度で表示され始めても驚かないでください。
この進歩は、FirstBightVenturesとPropelBioPartnersが共同で主導し、Y Combinator、Fifty Years、Susa Ventures、American CancerSocietyのBrightEdgeFund、Pioneer Fund、ZhenFundが参加したこの1500万ドルのシードラウンドを引き付けました。